一个团队在地球上发现了人类起源的线索，这个线索引领他们踏上太空之旅，来到了一个宇宙中最黑暗的角落。在那里，他们必须血战到底以保护人类在未来不被毁灭。

医学界的新秀伊丽莎白·伯恩医师是研究生物分子医学的菁英，受到医疗权威沃尔顿博士的赏识，邀请她加入研究小组，此时正逢伯恩的母亲罹患重症，为了帮助母亲，她便答应加入了这个名为“普罗米修斯”的研究计划，其目的是研究出干细胞再生血清，让罹患绝症的人可以因此受惠，此计划是秘密，不为外人所知的一项医学研究团队，每个团员都必须生活在密闭的空间，不得与外界联络，直到研究成功为止。 　　疯狂的医学研究，使得医师们突发奇想，把自杀身亡的员工，勒索失败的员工尸体，相继施做人体实验，即注入再生细胞的血清素，使其复活，但代价是，他

21世纪末，人类的科技水平已高度发达，克隆人技术和宇宙航行早已实现，不再是梦想。与此同时，许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。通过对许多古老文明的考察与对比，科学家伊丽莎白·肖（Noomi Rapace 饰）和查理·赫洛维（Logan Marshall-Green 饰）发现，人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。

该片改编自Kai Bird、Martin J. Sherwin所著书籍《美国普罗米修斯：奥本海默的胜与悲》，讲述了美国“原子弹之父”罗伯特·奥本海默在“二战期间”领导研制原子弹的过程，以及他在二战结束后遭遇不公正听证会的故事。